Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox17P56394 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox17P56394 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox17P56394 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox17P56394 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox17P56394 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox17P56394 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox17P56394 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox17P56394 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox17P56394 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox17P56394 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox17P56394 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox17P56394 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms