Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acod1P54987 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acod1P54987 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Acod1P54987 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms