Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb4P54761 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms