Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pms2P54279 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pms2P54279 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pms2P54279 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms