Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd7P50283 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd7P50283 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd7P50283 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd7P50283 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd7P50283 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms