Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbp3P49194 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbp3P49194 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms