Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3P48787 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms