Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcntP48725 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcntP48725 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcntP48725 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcntP48725 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcntP48725 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcntP48725 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcntP48725 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PcntP48725 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcntP48725 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcntP48725 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcntP48725 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcntP48725 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcntP48725 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcntP48725 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcntP48725 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcntP48725 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcntP48725 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcntP48725 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcntP48725 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcntP48725 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcntP48725 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcntP48725 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcntP48725 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcntP48725 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcntP48725 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PcntP48725 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcntP48725 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcntP48725 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcntP48725 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PcntP48725 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcntP48725 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcntP48725 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcntP48725 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcntP48725 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PcntP48725 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcntP48725 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PcntP48725 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcntP48725 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcntP48725 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcntP48725 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcntP48725 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcntP48725 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcntP48725 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcntP48725 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms