Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmc2P46471 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmc2P46471 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc2P46471 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms