Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sipa1P46062 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sipa1P46062 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sipa1P46062 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms