Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf4P43488 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms