Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gdf6P43028 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms