Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf2P39429 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf2P39429 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf2P39429 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf2P39429 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf2P39429 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms