Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sar1aP36536 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sar1aP36536 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sar1aP36536 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms