Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Oprk1P33534 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oprk1P33534 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Oprk1P33534 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms