Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxa11P31311 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms