Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd247P24161 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd247P24161 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd247P24161 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd247P24161 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd247P24161 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd247P24161 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd247P24161 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd247P24161 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd247P24161 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms