Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RarbP22605 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RarbP22605 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RarbP22605 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RarbP22605 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RarbP22605 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RarbP22605 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RarbP22605 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RarbP22605 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RarbP22605 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RarbP22605 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RarbP22605 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RarbP22605 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RarbP22605 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RarbP22605 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RarbP22605 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RarbP22605 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RarbP22605 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RarbP22605 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RarbP22605 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RarbP22605 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RarbP22605 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RarbP22605 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RarbP22605 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RarbP22605 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RarbP22605 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RarbP22605 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RarbP22605 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RarbP22605 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RarbP22605 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RarbP22605 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RarbP22605 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RarbP22605 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RarbP22605 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RarbP22605 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RarbP22605 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RarbP22605 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RarbP22605 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RarbP22605 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RarbP22605 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RarbP22605 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RarbP22605 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RarbP22605 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RarbP22605 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RarbP22605 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RarbP22605 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RarbP22605 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RarbP22605 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RarbP22605 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RarbP22605 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RarbP22605 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RarbP22605 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RarbP22605 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RarbP22605 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RarbP22605 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RarbP22605 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RarbP22605 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms