Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmnb2P21619 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms