Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Myo5bP21271 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myo5bP21271 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo5bP21271 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms