Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rps6ka3P18654 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka3P18654 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms