Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ass1P16460 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ass1P16460 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ass1P16460 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ass1P16460 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ass1P16460 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms