Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kcna1P16388 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms