Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30aP15533 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30aP15533 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms