Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmnb1P14733 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmnb1P14733 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmnb1P14733 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmnb1P14733 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms