Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54P14576 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54P14576 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54P14576 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54P14576 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54P14576 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54P14576 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms