Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Dnmt1P13864 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Dnmt1P13864 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Dnmt1P13864 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Dnmt1P13864 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms