Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06334 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06334 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06334 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06334 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06334 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06334 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06334 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06334 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06334 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06334 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06334 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06334 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06334 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P06334 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06334 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06334 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06334 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06334 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06334 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06334 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06334 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06334 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06334 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06334 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P06334 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P06334 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06334 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06334 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06334 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06334 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06334 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06334 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06334 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms