Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01658 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01658 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01658 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01658 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01658 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01658 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
P01658 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01658 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01658 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01658 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01658 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01658 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01658 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01658 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01658 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01658 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01658 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01658 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01658 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01658 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01658 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01658 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01658 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01658 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01658 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01658 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P01658 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01658 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01658 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01658 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01658 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01658 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01658 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms