Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01646 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01646 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01646 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01646 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01646 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01646 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01646 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01646 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01646 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01646 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01646 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01646 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01646 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01646 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01646 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01646 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01646 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01646 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01646 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01646 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01646 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01646 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01646 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01646 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01646 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01646 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01646 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01646 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01646 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01646 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01646 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01646 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01646 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01646 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01646 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01646 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01646 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01646 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01646 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01646 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01646 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01646 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01646 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01646 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01646 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms