Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl20O89093 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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