Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc6O89033 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc6O89033 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms