Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn3O88990 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn3O88990 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn3O88990 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn3O88990 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn3O88990 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn3O88990 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn3O88990 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms