Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema3fO88632 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3fO88632 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms