Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms