Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vti1bO88384 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vti1bO88384 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vti1bO88384 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms