Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Srpk1O70551 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms