Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmx1O70218 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms