Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35aO55142 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms