Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp26a1O55127 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp26a1O55127 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp26a1O55127 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp26a1O55127 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms