Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp10O55123 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms