Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccr6O54689 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms