Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg3O35902 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms