Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf18O35714 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf18O35714 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms