Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Xbp1O35426 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms