Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArxO35085 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArxO35085 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArxO35085 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArxO35085 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArxO35085 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArxO35085 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ArxO35085 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ArxO35085 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ArxO35085 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArxO35085 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArxO35085 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArxO35085 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ArxO35085 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArxO35085 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArxO35085 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArxO35085 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArxO35085 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArxO35085 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArxO35085 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArxO35085 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArxO35085 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArxO35085 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArxO35085 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArxO35085 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArxO35085 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArxO35085 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ArxO35085 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ArxO35085 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ArxO35085 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ArxO35085 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ArxO35085 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ArxO35085 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ArxO35085 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ArxO35085 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ArxO35085 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArxO35085 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArxO35085 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArxO35085 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArxO35085 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ArxO35085 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ArxO35085 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ArxO35085 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ArxO35085 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ArxO35085 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ArxO35085 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ArxO35085 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArxO35085 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms