Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dctn1O08788 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Dctn1O08788 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms