Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MttpO08601 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MttpO08601 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MttpO08601 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MttpO08601 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MttpO08601 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MttpO08601 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MttpO08601 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MttpO08601 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MttpO08601 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MttpO08601 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MttpO08601 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MttpO08601 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MttpO08601 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MttpO08601 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MttpO08601 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MttpO08601 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MttpO08601 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MttpO08601 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MttpO08601 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MttpO08601 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MttpO08601 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MttpO08601 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MttpO08601 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MttpO08601 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MttpO08601 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MttpO08601 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MttpO08601 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MttpO08601 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MttpO08601 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MttpO08601 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MttpO08601 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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