Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CltaO08585 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CltaO08585 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CltaO08585 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CltaO08585 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CltaO08585 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CltaO08585 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CltaO08585 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CltaO08585 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CltaO08585 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CltaO08585 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CltaO08585 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CltaO08585 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CltaO08585 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CltaO08585 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CltaO08585 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CltaO08585 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CltaO08585 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CltaO08585 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CltaO08585 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CltaO08585 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CltaO08585 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CltaO08585 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltaO08585 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CltaO08585 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CltaO08585 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltaO08585 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltaO08585 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CltaO08585 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltaO08585 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltaO08585 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltaO08585 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltaO08585 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltaO08585 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltaO08585 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltaO08585 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CltaO08585 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltaO08585 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltaO08585 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltaO08585 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltaO08585 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltaO08585 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltaO08585 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltaO08585 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltaO08585 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltaO08585 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
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