Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna2d1O08532 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms